La chapelle conserve sa configuration, au XVIIIème siècle vient s’adjoindre une sacristie ; elle est alors affectée à la confrérie de Notre-Dame du Boutdu- Pont. La vaste place qui s’étendait devant l’édifice appelée champ de manoeuvre permettait aux confrères de se réunir en nombre. En 1783, est construite la chapelle de l’hôpital général de l’autre côté du pont et dont subsiste la façade, elle pâtira de cette proximité. Désaffectée en 1793, elle subit les outrages de la spoliation ; ses statues, ses ornements et ses lampes votives d’argent disparaissent. Sur le tympan, les nouveaux propriétaires gravent « Magasin de l’hôpital de la Fraternité ». Un plancher est posé et elle est surélevée d’un étage.

Ce changement de destination sauve le bâtiment de la destruction. Il faut attendre 1857 pour qu’elle soit rendue au culte catholique et devienne un lieu de pèlerinage qui accueille les prières de familles des malades. L’évêque d’alors, Mgr de La Bouillerie, la rachète pour 5 000 francs, réalise des travaux dans un style néogothique pour lui redonner son allure et vient y célébrer solennellement une messe pour la fête de l’Immaculée conception, le 8 décembre. De nouveaux vitraux aux armes de l’évêque, d’un de ses prédécesseurs, Mgr Bazin de Bezons et de la famille d’Harcourt sont posés. Deux statues de Vierge à l’enfant sont installées ; une en plâtre polychrome dans le goût de Viollet-le- Duc disposée dans le choeur et une seconde, en 1875, à l’extérieur dans une niche gothique heureusement préservée.

La statue miraculeuse de Notre-Dame du Pont en pierre polychrome est entourée d’ex-voto et installée dans une niche à droite de la nef et date du XVIème siècle. Elle a été sauvée des affres révolutionnaires par une habitante de la Trivalle.

Le sanctuaire a conservé sa destination initiale ; un lieu de prière pour les malades et les habitants en difficulté. Cette dévotion est attestée par de nombreux ex-voto qui selon la mode de l’époque se traduisent par une plaque de marbre gravée. Ce qui n’empêche pas les familles modestes d’écrire à même le mur leurs prières et leurs reconnaissances. De nos jours, cette pratique se poursuit sur différents supports témoignant de la vitalité de la foi à Carcassonne. Elle est classée au titre des Monuments Historiques le 29 décembre 1932.